El timbrado de pagos en CFDI 4.0 lleva información adicional en su estructura. Por tal motivo es necesario volver a cargar el XML para extraer información de el y se utilice en el XML del pago.
Para corregir el error debe seguir los siguientes pasos:

1. Descargar el XML de la factura.
2. Dar clic en Acción - Cargar XML y seleccionar el XML descargado de la factura.
3. Volver a intentar realizar el pago.